Действие Type‑NOISE: Shonen Shojo разворачивается в изменённом варианте Токио, который одновременно узнаваем и слегка сбит с реальности. В этом городе оказываются шестеро подростков, лишённых воспоминаний о себе. Границы мегаполиса закрыты, и героям остаётся лишь блуждать по прихотливым коридорам и запутанным переходам, пытаясь понять, как выбраться наружу. Их путь - это попытка вернуть собственную историю, шаг за шагом поднимая со дна сознания забытые детали. Освободиться им нужно не столько от физической ловушки, сколько от тумана, скрывающего настоящие личные мотивы.