Touhou: Fearless Frogslayer открывается с любопытного и немного загадочного события. У дома Цирно появляется необычное объявление, которое мгновенно меняет привычный ход ее дня. Маленький клочок бумаги становится началом большого пути, ведущего вглубь Туманного озера, в котором привычные законы магии и природы переплетаются с чем-то новым и непознанным. А начнется все с заключения контракта с таинственной личностью, чьи мотивы остаются скрытыми. Однако цель предельно ясна: исследовать и постичь свойства неизвестного вида льда, чья мощь, возможно, превосходит все что Цирно ранее умела и знала.